intern note: Denne side kan nås via kortlinket bit.ly/2NN8idA

Links og resultater fra øvelsen - kan bruges sammen med den printede vejledning

Find data

http://www.cbioportal.org/

Eleverne skal få en figur frem i punkt 7, som ligner denne forholdsvis meget:

Data fra “Ovarian Serous Cystadenocarcinoma( TCGA, Nature 2011)”, figur fra cBioPortal

Arbejdsspørgsmål (besvarelser)

A. SVAR: Der ser ud til at være bedre overlevelse hos patienter med æggestokkræft, der har mutationer i BRCA1/BRCA2, end hos andre patienter med den samme kræftform.

B.

C. SVAR: LogRank P-testen har en værdi på 4,349 * 10^-4 (hvilket ses i din figurs øverste højre hjørne) hvilket er meget mindre end 0,05. Derfor skal man forkaste nulhypotesen om, at der ikke er forskelle i overlevelsen i de to grupper. Der er dermed statistisk evidens for, at patienter med æggestokkræft, der har mutationer i BRCA1/BRCA2, har bedre overlevelse end andre patienter med den samme kræftform.

D. SVAR: På basis af "Baggrund" i denne øvelse kan det være et fornuftigt bud, at patienter med BRCA1/BRCA2 måske er blevet diagnosticeret tidligere og derfor får et bedre forløb: Familiemedlemmer til patienter med de nævnte genændringer bliver tilbudt en gentest, og de bliver tilbudt at blive undersøgt for tegn på kræft, og derfor kan de måske diagnosticeres tidligere. Æggestokkræft diagnosticeres ellers ofte sent. I artiklen, som nævnes i ekstraopgave 4, kommer man ind på en række andre mulige årsagsforklaringer. Bedre behandlingsmuligheder kan også være en mulig forklaring.

"Several studies have examined survival after ovarian cancer for women with BRCA1 or BRCA2 mutations (4–14), and most report better survival for women with mutations (4,6–14). Observed differences in survival may be the result of differences in the intrinsic aggressiveness of hereditary vs nonhereditary cancers, differences in the ages of diagnosis and/or histologic subtypes, or differences in the response to chemotherapy. "

E.

Ekstraopgaver (et resultat samt alle links)

Ekstra 1 OBS! Der skal anvendes et andet studie, nemlig "TCGA, Firehose Legacy). Eleverne bør finde denne figur eller noget der ligner rigtig meget:

Ekstra 1 SVAR: Det samme gør sig IKKE gældende for brystkræft og BRCA1/BRCA2. LogRank P-værdien er 0,604 (varierer lidt efter hvilket studie der er anvendt), hvilket er meget mere end 0,05, og nulhypotesen om at de to gruppers overlevelse ikke er forskellige, må ikke forkastes, men accepteres.

Ekstra 2: www.cancer.dk. Der er angivet links, men hvis de ikke skulle virke, kan man prøve at søge oplysningerne frem via hjemmesidens søgefunktion.

https://www.cancer.dk/aeggestokkraeft-ovariecancer/aarsager-til-kraeft-i-aeggestokkene/

https://www.cancer.dk/hjaelp-viden/fakta-om-kraeft/aarsager-til-kraeft/aarsager-arvelighed/

Ekstra 3: https://aktuelnaturvidenskab.dk/fileadmin/Aktuel_Naturvidenskab/nr-6/AN6-2015dna.pdf

Ekstra 4: https://doi.org/10.1093/jnci/djs494

Abstract

Background

Studies have suggested that the 5-year survival of women with ovarian cancer and a BRCA1 or BRCA2 mutation is better than expected. We sought to evaluate the impact of carrying a BRCA1 or BRCA2 mutation on long-term survival of women after a diagnosis of invasive ovarian cancer.

Conclusion

For women with invasive ovarian cancer, the short-term survival advantage of carrying a BRCA1 or BRCA2 mutation does not lead to a long-term survival benefit.

Fra indledning til artiklen:

Several studies have examined survival after ovarian cancer for women with BRCA1 or BRCA2 mutations (4–14), and most report better survival for women with mutations (4,6–14). Observed differences in survival may be the result of differences in the intrinsic aggressiveness of hereditary vs nonhereditary cancers, differences in the ages of diagnosis and/or histologic subtypes, or differences in the response to chemotherapy.

Ekstra 5: http://pro.medicin.dk/